Альгология 2021, 31(1): 93–113

 

https://doi.org/10.15407/alg31.01.093

 

Нур Фадзліана А.Р., Ван Мазна В.О., Нор С.А.М., Чун Пін Фонг, Ло Вей

 

Різноманіття епіпельних ціанобактерій басейну р. Пінанг, Малайзія, виявлене за допомогою метагеномного підходу на основі 16S

 

Резюме

Ціанобактерії – найпоширеніша група фотосинтезуючих прокаріотів. Вони є основними продуцентами у різних місцезростаннях і здатні вегетувати в суворих умовах, включаючи забруднені води. Тому метою дослідження було вивчення угруповання ціанобактерій у річках з різним ступенем забруднення. Зразки донних осадів (епіпелон) були відібрані у басейні невеликої річки Пінанг (3,5 км завд.), що утворюється у результаті злиття річок Ейр-Терджун (T1) та Ейр-Ітам (T2); у середній частині басейну до неї впадають річки Донданг (T3) та Джелутонг (T4). Нижня ділянка р. Пінанг (Т5), розташована поблизу морської затоки, зазнає впливу солоної води під час припливів. Ідентифікацію ціанобактерій проводили за даними послідовності амплікону гена 16S рРНК. Амплікони генів 16S рРНК, генеровані із зібраних зразків, секвенували за допомогою ілюмінатора Miseq, причому цільові області V3 та V4 давали приблизно 1 млн зчитувань на зразок. У всіх зразках були виявлені Synechococcus С. Nägeli, Phormidium Kütz. ex Gomont, Arthronema Eschscholtz та Leptolyngbya Anagnostidis & Komárek. Індекс різноманітності Шеннона-Вейнера був найвищим (H’ = 1,867) на чистій станції вище за течією (T1), тоді як у помірно забрудненому допливі (T3) зафіксовано найнижчу різноманітність ціанобактерій (H’ = 0,399), на відносно забруднених станціях (T4, T5) відмічено досить високі значення Н’. Це дослідження дає уявлення про структуру угруповань ціанобактерій у басейні р. Пінанг за допомогою незалежних від культивування методів із використанням послідовності амплікону гена 16S рРНК. Поява деяких морфовидів у певних місцях показала, що угруповання ціанобактерій досить чіткі та мають специфічні екологічні вимоги. Деякі види зафіксовані на всіх досліджених ділянках, що свідчить про їхню здатність переносити різноманітні умови навколишнього середовища.

 

На головну